- Analyses des données d’imagerie pour la technologie Hypérion :
• Visiopharm, regroupant les outils permettant d’effectuer les étapes de segmentation, de contrôle qualité, de masques et identifications cellulaires, de visualisation d’image et d’exports de données pour des analyses plus approfondie de la diversité en cellules et de l’organisation du tissu.
A l’aide de ces outils, CyPS propose de nombreuses analyses et représentations avec notamment des outils :
- de normalisation et nettoyage des données : subsampling, FlowAI, FlowCUT, CytoNorm
- de visualisation des données : réductions dimensionnelles t-SNE, UMAP, TriMap, PCA,..
- de clustering : Heatmap, SPADE, FlowSOM, Phenograph, …
- d’analyses de trajectoires : Wanderlust, Wishbone, DiffusionMap, Monocle,...
ainsi que tout autres algorithmes ou types d’analyses nécessaires et applicables aux jeux de données obtenus sur les différentes technologies OMIC de la plateforme.
Des formations personnalisées en analyses complexes des données sont proposées. N'hésitez pas à nous soumettre vos besoins.
